（1）容易出現(xiàn)配置重復(fù)，資源浪費(fèi)的問(wèn)題。

　　（2）項(xiàng)目組織成為一個(gè)相對(duì)封閉的組織，公司的管理與對(duì)策在項(xiàng)目管理組織中貫徹可能遇到阻礙。

　　（3）項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)與公司之間的溝通基本上依靠項(xiàng)目經(jīng)理，容易出現(xiàn)溝通不夠，和交流不充分的問(wèn)題。

　　（4）項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)成員在項(xiàng)目后期沒(méi)有歸屬感。

　　（5）由于項(xiàng)目管理組織的獨(dú)立性，使項(xiàng)目組織產(chǎn)生小團(tuán)體的觀念，在人力資源與物資資源上出現(xiàn)“屯積”的思想，造成資源浪費(fèi)；同時(shí)，各職能部門考慮其相對(duì)獨(dú)立性，對(duì)其資源的支持會(huì)有所保留。