基本農田保護區(qū)劃定的程序包括編制總體規(guī)劃、劃區(qū)定界、設立保護標志、建立檔案、驗收確認等方面。

　　1.編制總體規(guī)劃，確定保護方案。劃定基本農田保護區(qū)的依據(jù)是土地利用總體規(guī)劃。

　　2.劃區(qū)定界，編繪基本農田保護區(qū)圖�；�本農田保護區(qū)以鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）為單位劃區(qū)定界，由縣級人民政府土地行政主管部門會同同級農業(yè)行政主管部門組織實施。

　　3.設立標志。劃定的基本農田保護區(qū)，由縣級人民政府設立保護標志，予以公告。任何單位和個人不得破壞或者擅自改變基本農田保護區(qū)的保護標志。

　　4.建立檔案。由縣級人民政府土地行政主管部門建立檔案，并抄送同級農業(yè)行政主管部門。

　　5.驗收確認。基本農田劃區(qū)定界后，由省、自治區(qū)、直轄市人民政府組織土地行政主管部門和農業(yè)行政主管部門驗收確認，或者由省、自治區(qū)人民政府授權設區(qū)的市、自治州人民政府組織土地行政主管部門和農業(yè)行政主管部門驗收確認。