工程總承包管理模式下的合同風險有：設計風險、施工風險、意外風險、物價風險、工程變更等。

1、設計風險

設計風險包括的內容較廣，除合同規(guī)定的重大變更允許總價調整以外設計文件的錯漏、設計失誤與不周引起工程變更的風險均由總承包單位負擔，其中設計單位的資質信譽、設計與施工的年限差距是影響設計風險的主要因素之一。

2、施工風險

在施工過程中，隱蔽工程（包括基礎工程、軟基處理等）是投資突破的主要項目；如設計與實際地形不符導致樁基變化、軟基處理設計的范圍、厚度不能滿足要求等情況；這些對于具有經(jīng)驗的承包人也是很難預料的。

3、意外風險

由總承包單位向保險公司購買工程一切保險、第三者責任險和其它應買險種保單，以確保工程在遭受意外風險或其他人為責任事故時，能得到合理補償并免除承擔涉外賠償或其他責任。

4、物價風險

為了保證工程質量，業(yè)主向總承包人供應主要材料，如水泥、鋼筋、鋼絞線、瀝青等，物價上漲的風險會在我國建設市場宏觀調控的大形勢下逐漸減少。

5、工程變更

由于地方遠期發(fā)展的要求，地方政府會提出一些新暗的工程項目，或要求提高某單項工程標準，由此增加的費用將會按總承包合同條款的雙方約定分別承擔。