對于不良的生態(tài)平衡，興修水利工程本身就是對其進行良性改造，使之朝著有利于人類的健康方向發(fā)展。關(guān)鍵是我們在工程施工過程中，怎樣盡最大努力去減小人類對其的不良影響。這就給工程的建設者們提出了以下任務：

（1）規(guī)劃設計的前期，要切實搞好工程所在地水文資料的收集及地質(zhì)條件的勘測。如大型蓄水庫，重點是水文資料和地質(zhì)構(gòu)造，充分考慮大壩的防洪能力、穩(wěn)定性以及避免地震的誘發(fā)。

（2）規(guī)劃中還應設計一定的工程構(gòu)造，以滿足大壩流域內(nèi)水生物的生活習性，減少庫區(qū)淹沒范圍。

（3）施工階段的任務：

①在施工承包合同的簽訂時，承包商對施工現(xiàn)場污染物的擴散和施工人員的勞動保護所應負的責任，應寫進合同書內(nèi)，要有環(huán)保措施，對各種污染物排放要限制在標準以內(nèi)。

②施工前要在施工現(xiàn)場建立必要的環(huán)保監(jiān)測機構(gòu)，進行水質(zhì)、大氣、噪聲的本底測定，便于和施工階段不同時期的監(jiān)測結(jié)果進行對比。

③施工人員進入工地后，還要建立衛(wèi)生防疫機構(gòu)，以避免施工期數(shù)萬工人集中在一起，引起流行病的傳播和擴散。這方面的教訓，在我國大躍進時期的興修水利中是十分深刻的。

（4）施工后期的任務。特別要對施工階段破壞的植被景觀及時恢復，制訂工區(qū)的全面綠化規(guī)劃，以保護已經(jīng)形成的生態(tài)平衡。在工區(qū)范圍內(nèi)的生物圈內(nèi)，研究生物資源的利用、保護和生產(chǎn)的合理方式，控制規(guī)劃人群自身的發(fā)展，保持生物種群的恰當比例。