工程設計階段。對工程設計內容界定不明確，特別是技術改造項目，將不需重新設計的折舊設備及設施的造價計入工程成本，從而使設計費用過高。另一方面，設計深度達不到甲方要求，要么投資失控，要么技術達不到實際要求。

　　工程施工前期。第一，工程招標時沒有按招標程序公開招標，采用雙方私下議標方式，雖然該方式可以為甲方節(jié)約招標費用，但由于沒有優(yōu)選施工單位，施工期間施工單位可能先答應甲方的一切苛刻條件，并想方設法把工程攬到手，然后在施工期間通過費用索賠或結算糾紛獲利。第二，關于合同協(xié)議內容，目前國家建設部和國家工商總局已聯(lián)合制定了建設工程施工合同示范文本，但許多業(yè)主素質不高，合同協(xié)議條款不嚴密，或與國家法律、法令、條例、技術規(guī)范、圖紙等相違背，或約定的權利和義務不明確，為日后經濟糾紛埋下種子。第三，建設單位任意指定分包單位，但又不以合同形式明確總包單位與分包單位的權利與義務。第四，在資金方面，施工準備期內，乙方為攬到工程，會提出一些優(yōu)惠條件，如帶資或墊資承包，結算時又提出利息問題。

　　工程施工階段

　　第一，工程施工過程中工程量的變更。在施工中，如遇到不利的自然條件和人為障礙，就要增加處理人為障礙的人工、材料和機械費用等。另外，如果一項工程由多家施工，那么就會帶來施工配合費用及交叉施工的問題。

　　第二，有關施工材料方面。如施工中實際用料的數(shù)量與質量，與設計料表出入較大，而雙方又沒有及時溝通，導致結算糾紛；或者施工材料的采購與保管，雙方未達成一致，其保管費用引起糾紛。

　　第三，甲方的特殊要求，如合同以外的檢查、試驗、加快工程進度、提前占用工程等，引起雙方的糾紛。

　　第四，在工程驗收階段，由于施工工程質量缺陷，如屋面防水不好、引起滲漏等起糾紛。

　　工程竣工期。施工單位高估冒算，建設單位片面壓價引起同一工程結算價差異較大；工程結算方式，按形象進度結算，存在一定的主觀性，容易引起糾紛。

　　減少糾紛靠管理

　　加強設計環(huán)節(jié)管理。首先，甲乙雙方要加強工程技術方案的溝通，明確雙方的責任、義務。第二，對設計單位嚴格推行限額設計，一方面要求設計人員加強工程技術經濟分析，在限定的投資條件下，優(yōu)化設計；另一方面以人為本，提高設計人員素質，加大設計深度，力求最大限度使建設方滿意。

　　加強合同履行管理。簽訂協(xié)議盡量采用合同示范文體，對附加條款要仔細推敲，并請有關專家指導；妥善處理合同變更問題。

　　加強施工各階段管理。首先要求施工管理人員及預算審定人員要深入現(xiàn)場掌握第一手資料。其次要求施工方在建設方的變更指令下進行施工，然后雙方要簽定新的協(xié)議，以免發(fā)生爭端。對施工中乙方自購的材料，必須經甲方進行質量認可，避免結算糾份。對隱蔽工程加強檢查，完善隱蔽工程現(xiàn)場簽證手續(xù)。

　　加強審查管理�？⒐そY算時，切實本著實事求是的態(tài)度，深入細致進行工程施工預算審查。對工程量不重不漏，依據(jù)施工組織設計，深入施工現(xiàn)場，實地核實工程量；定額套項合理，基價換算正確，費用計取要與企業(yè)資質證書、核定工程類別相符等。