通常合同分析首先針對具體的合同條款（或合同結構中的子項）。根據(jù)它的表達方式，分析它的執(zhí)行將會帶來什么問題和后果。在此基礎上還應注意合同條款之間的內在聯(lián)系。同樣一種表達方式，在不同的合同環(huán)境中，有不同的上下文，則可能有不同的風險。

由于合同條款所定義的合同事件和合同問題具有一定的邏輯關系（如實施順序關系，空間上和技術上的互相依賴關系，責任和權力的平衡和制約關系，完整性要求等），使得合同條款之間有一定的內在聯(lián)系，共同構成一個有機的整體，即一份完整的合同。例如：

有關合同價格方面的問題涉及：合同計價方法、量方程序、進度款結算和支付、保留金、預付款、外匯比例、竣工結算和最終結算、合同價格的調整條件、程序、方法等。

工程變更問題涉及：工程范圍，變更的權力和程序，有關價格的確定，索賠條件、程序、有效期等。

它們之間互相聯(lián)系，構成一個有機的整體。通過內在聯(lián)系分析可以看出合同中條款之間的缺陷、矛盾、不足之處和邏輯上的問題等。