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1．質量管理問題

工程單位的生存和發(fā)展無法離開質量，使用者對質量的認可是衡量一項工程成敗與否的關鍵，因此，在水利工程的施工之中，應該將建設的質量和數量、規(guī)模處于同等重要的位置之上，我國目前的施工過程中，主要含有以下幾個缺陷。首先，沒有進行適宜的設計，在項目得到立項之前，就應該及時聘請專家對該項目進行論證，了解項目的可行性，將建設不適宜的問題盡量避免，使用民辦公助等方式實施水利工程建設。建設資金較少，存在因陋就簡等不合理意識，我國水利部門已經完善了相關行業(yè)規(guī)范、技術標準和法律法規(guī)，但是很多水利單位和個人沒有將要求落實到實處。第二，沒有完善的監(jiān)控措施，很多基層的水利部門沒有建設質量保證體系，沒有完善的質量監(jiān)控措施，尤其是一些施工單位沒有形成思想理念，很多小型工程的質量監(jiān)控多使用目測的方式，缺乏引進先進的儀器和監(jiān)測設備，人才斷層嚴重，在質量監(jiān)控的實施過程中缺乏權威性。

2．施工合同管理問題

（1）招標不夠規(guī)范。隨著“三制”改革的深入開展，水利工程建設市場不斷向規(guī)范化的方向發(fā)展，但是因為施工合同雙方存在著利益矛盾，在合同中有明確的體現，例如，在一些工程招標的過程中，很容易對承包人提出十分苛刻的條件，使承包人不斷壓價，造成十分嚴重的額外負擔，甚至使中標價格不斷壓低，造成承包人十分嚴重的經濟損失，同時，一些承包人為了使中標率水平不斷提高，進行聯(lián)合投標，甚至產生串通等現象，使中標價格不斷提高，形成惡性競爭，不利于建設市場的良性發(fā)展，使管理水平和施工力量較好的承包人無法中標，項目不能夠有效實施，無法準確保證工程質量，造成施工合同管理水平下降。

（2）很多內部缺乏對管理重要性的認識水平，很大程度上存在著只重視建設而輕視管理的思想，在我國近幾年經濟發(fā)展的過程中，只重視對成本的增加，但是在進行基礎設施建設的時候，沒有對提高管理水平的重視，導致沒有對權利和責任進行明確的劃分，水利工程大部分為綜合開發(fā)、綜合利用工程。公益性工程和經營性工程合在一起，公益性資產和經營性資產界定不清，無法自主經營，需要國家財政進行相應的補貼，很多進行多種經營，因為和施工具有多種聯(lián)系，自身沒有法人資格，不能獨立經營、自負盈虧，實現預定的化運行管理目標的外部條件和內部囚素都不具備．運行機制無法按現代制度運作。部分水管單位責任主體不明晰。一些水利工程部門在管理的過程中沒有實施嚴格的分級管理措施，無法對有限的水資源進行統(tǒng)一調度和優(yōu)化配置，一些水利行政管理部門只具有業(yè)務管理的權限，卻無法進行人事管理，造成了只管事不管人的局面，一些水管單位和水利設施單位的管理無法有效實施。