對(duì)于經(jīng)營(yíng)性的小型農(nóng)田水利設(shè)施建設(shè)，在項(xiàng)目建成投入使用后會(huì)使較多的農(nóng)戶受益，特別是對(duì)于一些遠(yuǎn)距離輸送水工程，可能要跨越不同的鄉(xiāng)鎮(zhèn)和村莊，由于各地的情況不一管理的難度增大，這就需要相關(guān)的管理部門根據(jù)水系與溝渠的分布特征，建立起合理的水利資源管理組織，對(duì)小型農(nóng)田水利設(shè)施和資源進(jìn)行專門管理，在具體實(shí)施時(shí)，可以打破行政區(qū)劃的限制，由上級(jí)主管部門進(jìn)行統(tǒng)一規(guī)劃，建立適用小型農(nóng)田水利建設(shè)及管理的管理組織，這種管理模式能夠有效防止鄉(xiāng)村以各種手段侵占小型農(nóng)田水利建設(shè)及運(yùn)營(yíng)管理經(jīng)費(fèi)。要將水利設(shè)施的建設(shè)者、所用者以及收益者之間建立起密切的聯(lián)系，使之成為一個(gè)密不可分的利益共同體，以相互合作的方式保證小型農(nóng)田水利建設(shè)及管理的各個(gè)成員的利益得以實(shí)現(xiàn)，同時(shí)各方也要明確自身的責(zé)任與義務(wù)，嚴(yán)格執(zhí)行各項(xiàng)規(guī)章制度。

　　對(duì)專門從事小型農(nóng)田水利建設(shè)及管理工作的組織，要依法進(jìn)行登記注冊(cè)，取得相關(guān)證書后才能進(jìn)行執(zhí)業(yè)。在組織內(nèi)部要建立起管理規(guī)章制度，積極進(jìn)行專業(yè)人才的引進(jìn)和選拔，落實(shí)各項(xiàng)建設(shè)管理任務(wù)，保證水利設(shè)施的正常使用。