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1、審查施工合同的符合性及完備性首先要熟悉招標、投標文件，關注施工合同條款與招標文件以及投標承諾的符合性，檢查是否存在背離條款；其次檢查對于在招投標過程中形成的補遺，修改、書面答疑、詢標紀要、各種協(xié)議等是否均已作為合同文件的組成部分，是否明確解釋順序。

2、審計施工合同通用條款內(nèi)容的重點檢查合同當事人的法人資質(zhì)、合同內(nèi)容是否符合相關法律和法規(guī)的要求；檢查合同的內(nèi)容是否與招標文件的要求相符合；檢查合同條款是否全面、合理，有無遺漏關鍵性內(nèi)容，有無不合理的限制性條件，法律手續(xù)是否完備；檢查合同雙方是否具有資金、技術及管理等方面履行合同的能力；檢查合同是否明確規(guī)定雙方的權利和義務；檢查合同是否存在損害國家、集體或第三者利益等導致合同無效的風險；檢查合同是否有過錯方承擔締約過失責任的規(guī)定；檢查合同是否有按優(yōu)先解釋順序執(zhí)行合同的規(guī)定。

3、審計施工合同專用條款內(nèi)容的重點檢查合同是否明確規(guī)定工程范圍，工程范圍是否包括工程地址、建筑物數(shù)量、結構、建筑面積、工程批準文號等；檢查合同的工程質(zhì)量標準是否符合有關規(guī)定；檢查質(zhì)量保證期是否符合有關建設工程質(zhì)量管理的規(guī)定，是否有履約保函；檢查合同是否明確規(guī)定工期，以及總工期及各單項工程的工期能否保證項目工期目標的實現(xiàn)；檢查合同工程造價計算原則、計費標準及其確定辦法是否合理；檢查所規(guī)定的付款和結算方式是否合適；對合同中關于工程價款結算調(diào)整條件應在合同專用條款部分針對招標文件作詳細約定，避免合同在執(zhí)行過程中在施工、竣工結算階段產(chǎn)生爭議；檢查合同是否明確規(guī)定設備和材料供應的責任及其質(zhì)量標準、檢驗方法；檢查隱蔽工程的工程量的確認程序及有關內(nèi)部控制是否健全，有無防范價格風險的措施；檢查中間驗收的內(nèi)部控制是否健全，交工驗收是否以有關規(guī)定、施工圖紙、施工說明和施工技術文件為依據(jù)；檢查合同所規(guī)定的雙方權力和義務是否對等，有無明確的協(xié)作條款和違約責任。

4、對于采用工程量清單計價的施工合同重點審計其條款是否符合《建設工程工程量清單計價規(guī)范》的有關規(guī)定：合同中只有類似的變更工程的價格，可以約定參照類似價格變更合同價款給與差價補償原則，防止不平衡報價；尤其是對于清單中沒有涉及到的項目變更，其定價原則、方式要明確，建議可以采用參照定額組價的模式，即工程人機材耗量參考定額，人機材單價采用信息單價，取費參照投標報價；對于工程量變化綜合價格的調(diào)整，建議事前約定工程量變化超過規(guī)定幅度值時綜合單價的調(diào)整公式；對材料價格較大幅度變化等因素造成的價格調(diào)整，應約定分擔原則或調(diào)價公式；在施工過程中變更施工方案、采取趕工措施等是否增加費用，也應加以明確。